EUROFINS GENOMICS

The DNA Universe

Fondée en 1990, Eurofins Genomics fait partie du groupe Eurofins Scientific qui regroupe plus de 800 laboratoires dans 47 pays et plus de 55.000 employés. Numéro 1 en Europe pour les services génomiques, Eurofins Genomics prend en charge des dizaines de milliers de clients dans divers secteurs : recherche, pharmaceutique, diagnostic, agriculture, alimentation et biotechnologie.

Certifiée ISO 9001 et ISO 13485, Eurofins Genomics est également certifiée ISO 17025 pour le séquençage NGS.

Oligonucléotides : synthèse de sondes et primers pour PCR

• Oligonucléotides ADN et ARN

Oligonucléotides ADN à façon en tube et en plaque

Echelle de synthèse :  0,01 à 10 µmol
Options de purifications : dessalé, HPSF ou HPLC
Longueurs de séquence possible : 5 à 120 bases pour les oligonucléotides non modifiés (5 - 80 bases pour un oligonucléotide avec modification)
Nous proposons également pour les oligonucléotides de 60 à 200 bases en tube, notre qualité de synthèse et de purification Extremers.
Au-delà de 200 bases nous recommandons nos Genestrands (ou gene fragment) ou notre service de synthèse de gènes.

Oligonucléotides ADN à façon en plaques 96 puits

Échelles de synthèse : 0,01 µmol, 0,05 µmol et 0,2 µmol avec des rendements minimums en OD identiques à la version tube
Nanoscale Plate : 1 à 2 OD  pour les sondes de 5 à 50 bases
Options de purifications proposées : dessalé, HPSF, HPLC

Des gammes d’oligos spécialisés pour certaines applications sont également disponibles : Optimised Application Oligos. Leur synthèse a été mise au point (augmentation du taux d’amorçage, fiabilité de la séquence, pureté de la synthèse etc..) au sein de nos laboratoires afin d’obtenir de meilleurs résultats pour nos prestations de services mais également pour les mettre à la disposition de nos clients afin d’améliorer leur propres résultats.

Modifications

Les Customs DNA Oligos  peuvent avoir également des modifications par incorporation directe au cours de la synthèse ou en post synthèse :

Modifications en 3’
La synthèse automatisée d’oligonucléotides étant réalisée de 3 ’en  5’, ces modifications ne sont possibles que si le support solide correspondant (colonne CPG) est disponible et si la modification est compatible avec les propriétés chimiques utilisées lors de la synthèse.

Modifications en 5’ ou interne
De nombreuses modifications peuvent être introduites directement en 5’  ou en  interne des oligonucléotides en utilisant les phosphoramidites. Ces modifications doivent accepter les conditions de déprotection et de pH.

En post-synthèse
Deux réactions majeures de post-synthèse sont utilisées pour introduire des colorants sensibles ou des composés qui n'existent pas sous forme de phosphoramidites. Dans le premier cas, le marqueur est conjugué à un oligonucléotide amino-modifié (3 ’, 5’ ou sur un dT) en utilisant sa version amino-réactive (l’ester N-hydroxysuccinimide (NHS) dans la plupart des cas). La deuxième possibilité (à l'origine également utilisée pour la synthèse de balises moléculaires) est l'ajout d'un marqueur modifié par maléimide à un oligonucléotide modifié par thiol.

Séquençage par la méthode Sanger

Nous réalisons les séquençages d’acides nucléiques tels que les produits de PCR*, les plasmides*, les BACs,.. Ceux-ci peuvent être purifiés ou non purifiés, en plaques 96 puits ou en tubes individuels.

Sur une même plaque 96 puits, vous pouvez commander des séquençages avec 1 à 96 amorces différentes et jusqu’à 4 réactions par puits.
Dans un tube individuel, vous pouvez commander jusqu’à 8 réactions de séquençages avec des amorces différentes.

Les amorces sont à choisir parmi nos amorces standard gratuites ou à nous commander pour que nous les synthétisions. (cf paragraphe 1 :  Synthèse d’oligonucléotides, sondes et primers pour PCR)
Selon le cas, nous pouvons ramasser les échantillons quotidiennement sur votre site.

Séquençages en plaques : services PlateSeq Supreme
Vous pouvez nous envoyer différents types de matériels :
- ADN purifié
- PCR non purifiées
- clones sur agar
- cultures liquides

Séquençages en tubes :
- service TubeSeq Supreme : soit ADN déjà purifié, soit purification en option
- service TubeSeq NightXpress : tubes barcodés fournis, résultats express si Dropbox express sur site ; condition : ADN purifié
- service Mix2Seq : tubes tubes barcodés fournis; conditions : ADN purifié et pré-mixé avec l’amorce

*Pour des séquençages de plasmides entiers et amplicons entiers jusqu’à 25 kb, voir la section NGS, services ONTLite

Séquençage NGS

Depuis plus de deux décennies, nous proposons des solutions innovantes et globales autour du séquençage de l’ADN/ARN et de l´analyse bio-informatique des données. Eurofins Genomics a séquencé plus de six millions d´échantillons, dont des dizaines de milliers de génomes végétaux, de bactéries et autres organismes, ainsi que des centaines de génomes humains.

Équipé de toutes les technologies de pointe – dont l’Illumina® et Oxford Nanopore®, nous maîtrisons parfaitement les différents avantages de chacune d´entre elles. Ceci nous permet de fournir à chaque client la solution la plus adaptée à son projet : que ce soient des solutions standardisées et automatisées (INVIEW et NGS select) mais également des solutions individualisées selon votre projet.

Nous avons à disposition de multiples plateformes de séquençage pour assurer le meilleur choix et rendement en fonction des projets : Illumina® MiSeq, Illumina® HiSeq 4000, Illumina® NovaSeq 6000, et Oxford Nanopore® GridION (liste non exhaustive).

Nos Plateformes NGS : Les technologies

En matière de séquençage à haut débit d'ADN et d'ARN, Eurofins Genomics utilise les plateformes NGS les plus fiables, éprouvées et leaders du marché.
Les plates- formes Illumina® NGS sont les dispositifs NGS leaders du marché et excellent en termes de sortie, de précision et de qualité de séquençage. Ils sont basés sur la technologie de séquençage par synthèse . Les plateformes éprouvées et bien établies NovaSeq 6000 et MiSeq nous permettent de fournir des données NGS de 13 Go à 6 000 Go par run.
Le Nanopore GridION d'Oxford Nanopore® Technologies se distingue par des longueurs de lecture exceptionnelles de plus de 4 000 000 bp (4 Mb). Il est basé sur la dernière technologie de séquençage des nanopores   et fournit des données NGS jusqu'à 50 Go par cycle.

Nos services de séquençage optimisés « ONTLite » en Oxford Nanopore

WHOLE PLASMID SEQUENCING (WPS) : séquençage de plasmides entiers, sans amorce, et reconstitution de la carte du vecteur, dès 15 €
Rapport type WPS

LINEAR/CLONAL AMPLICON (LCA) : séquençage d’amplicons clonaux jusqu’à 25 kb, sans amorce, et reconstitution de la carte, dès 15 €
Rapport type LCA

BACTERIAL GENOME SEQUENCING (BGS): séquençage de génomes de bactéries isolées (max 7 Mb) dès 90 € : Inclus: assemblage de novo assembly et QC, identification de l’espèce, et annotation
Rapport type BGS

Synthèse de gènes

Optimisez vos recherches et gagnez du temps grâce à nos services de synthèse de gènes et de plasmides entiers, et nos prestations de biologie moléculaire de haute qualité.

Lien vers le blog

Synthèse de gènes

Séquençage par la méthode Sanger

Oligonucléotides : synthèse de sondes et primers pour PCR